Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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