Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms