Protein–RNA interactions for Protein: Q86WS5

TMPRSS12, Transmembrane protease serine 12, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS12Q86WS5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS12Q86WS5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms