Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms