Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms