Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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