Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms