Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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C9orf135Q5VTT2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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C9orf135Q5VTT2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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C9orf135Q5VTT2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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C9orf135Q5VTT2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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C9orf135Q5VTT2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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