Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms