Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms