Protein–RNA interactions for Protein: Q49A92

C8orf34, Uncharacterized protein C8orf34, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf34Q49A92 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf34Q49A92 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms