Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TRIM16LQ309B1 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TRIM16LQ309B1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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