Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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