Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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