Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTN1Q16799 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
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