Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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