Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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