Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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