Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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