Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms