Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHBQ15464 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHBQ15464 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHBQ15464 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHBQ15464 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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