Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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