Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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BRD3Q15059 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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BRD3Q15059 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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BRD3Q15059 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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