Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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RAB3GAP1Q15042 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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RAB3GAP1Q15042 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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RAB3GAP1Q15042 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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RAB3GAP1Q15042 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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RAB3GAP1Q15042 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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RAB3GAP1Q15042 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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RAB3GAP1Q15042 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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