Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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LAPTM4AQ15012 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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LAPTM4AQ15012 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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LAPTM4AQ15012 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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LAPTM4AQ15012 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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LAPTM4AQ15012 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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LAPTM4AQ15012 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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LAPTM4AQ15012 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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LAPTM4AQ15012 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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LAPTM4AQ15012 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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