Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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