Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms