Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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