Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
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SHROOM2Q13796 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
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SHROOM2Q13796 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
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SHROOM2Q13796 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
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SHROOM2Q13796 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHROOM2Q13796 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
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SHROOM2Q13796 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
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SHROOM2Q13796 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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SHROOM2Q13796 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
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SHROOM2Q13796 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
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