Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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