Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
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