Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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