Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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