Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR5A1Q13285 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms