Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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