Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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