Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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