Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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