Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC10A2Q12908 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC10A2Q12908 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms