Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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