Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms