Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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