Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms