Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms