Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms