Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms