Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms