Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms