Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms