Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FLI1Q01543 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FLI1Q01543 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms